أنشئ قسم الكيمياء منذ عام 1393/1394هـ ويعد من أكبر أقسام الكلية حيث تمتد خدماته إلى قطاعات كبيرة من الطلاب داخل الكلية وخارجها. والقسم مزود بالعديد من المعامل المجهزة للوفاء بالأغراض التعليمية والبحثية ، وبعض هذه المعامل ذات إعداد خاص حيث تضم أجهزة متقدمة للتحليل الكيميائي. وتقدم خدماتها إلى بقية أقسام الكلية وبعض الكليات الأخرى بالجامعة بالإضافة إلى خدمة قطاعات أخرى خارج الجامعة. وللاستفادة من هذه الإمكانات المعملية والكفاءات والخبرة العلمية لأعضاء هيئة التدريس بالقسم ، فقد كان قسم الكيمياء سابقاً إلى تشجيع البحث العلمي وتنشيطه والبدء في برنامج الدراسات العليا للحصول على درجة الماجستير منذ عام 1398هـ. وقد تم تطوير برنامج الماجستير بالمقررات الدراسية والرسالة مع استحداث برنامج الماجستير بالمقررات الدراسية والمشروع البحثي وكذلك برنامج الدكتوراه بالمقررات الدراسية والرسالة في الفصل الأول 1425/1426هـ ، 2005/2006م يقوم القسم باستخدام الوسائل الحديثة مثل الكمبيوتر في التدريس ووسائل الاتصال الحديثة مع الطلاب عن طريق الإنترنت.